Egenbetalingen fastsættes individuelt, idet der tages hensyn til den visiterede persons personlige forhold. Der indgås en aftale mellem beboer, visiterende myndighed og Skotteruphus vedrørende betalingsgangen ved egenbetaling. Det er den visiterende kommune som har ansvaret for, at den unge sættes i egenbetaling, hvis dette skønnes.